264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2249 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  100 
 
 
171 aa  349  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  40.43 
 
 
156 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  38.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  40.14 
 
 
149 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  38.41 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  38.41 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  37.32 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  36.84 
 
 
152 aa  95.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  39.16 
 
 
149 aa  94.4  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  36.23 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  41.67 
 
 
334 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  33.79 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 
152 aa  90.9  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  39.86 
 
 
152 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  38.03 
 
 
147 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  33.81 
 
 
151 aa  88.2  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  36.6 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  35.62 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  38.69 
 
 
180 aa  87.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  39.58 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  37.32 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  37.04 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  37.04 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  37.04 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  33.78 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  39.84 
 
 
334 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  35.66 
 
 
152 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  36.51 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  36.3 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  36.3 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  36.3 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  36.3 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  34.67 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  34.27 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  37.3 
 
 
147 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  37.01 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  35.92 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  44.34 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  35.66 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  36.31 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  35.29 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  39.53 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  34.94 
 
 
334 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  34.19 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  34.07 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  36.3 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  37.25 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  34.07 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 
332 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  35.85 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  32.64 
 
 
352 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  35.43 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  37.59 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  38.46 
 
 
329 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  36.43 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  35.88 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  33.33 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  34.93 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  33.96 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  32.87 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  33.79 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  32.14 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  35.43 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  37.93 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  32.21 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  34.27 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  32.59 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  32.59 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  34 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  34.35 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  35.11 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  36.43 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  34.03 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  33.33 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  36.44 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  29.01 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  29.01 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  29.01 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  30.82 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  30.61 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  37.18 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  29.93 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  30.41 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  31.03 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  31.58 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  32.08 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  31.61 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>