263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4680 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  67.86 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  65.13 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  63.64 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  62.68 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  57.79 
 
 		 154 aa  176  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  56.55 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  65.73 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  50.7 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  64.34 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  54.48 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  47.55 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  53.47 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  42.36 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  41.96 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  37.58 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  36.91 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  40.15 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  41.96 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  37.91 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  36.43 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  38.06 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  41.55 
 
 		 332 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  40.44 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  40.26 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  40.28 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  39.61 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  35.71 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  35.71 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  35.71 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  36.55 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  41.53 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  41.53 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  41.53 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  41.53 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  37.91 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  37.66 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  41.98 
 
 		 334 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  40.14 
 
 		 352 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  39.44 
 
 		 332 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  40.68 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  39.39 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  40.15 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  37.93 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  38.57 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  35 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  36.77 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  42.75 
 
 		 334 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  36.81 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  33.57 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  36.11 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  34.48 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  32.86 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  32.86 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  35.42 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  36.99 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  36.99 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  31.17 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  34.03 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  34.48 
 
 		 334 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  32.41 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  32.86 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  33.77 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  35.17 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  38.81 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  34.03 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  37.31 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  36.57 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  31.72 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  33.99 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  35.04 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  34.64 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  33.33 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  37.9 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  37.41 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  33.8 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  33.33 
 
 		 329 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  32.31 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  32.31 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  32.31 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  34.56 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  32.88 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  30.99 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  32.87 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  31.78 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4775  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>