204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1420 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
160 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  74.68 
 
 
160 aa  253  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  72.33 
 
 
160 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  71.15 
 
 
160 aa  237  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  69.81 
 
 
159 aa  227  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  72.78 
 
 
161 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  69.81 
 
 
160 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  51.97 
 
 
329 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  49.67 
 
 
160 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  49.67 
 
 
160 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  47.47 
 
 
160 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  54.55 
 
 
334 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  46.84 
 
 
158 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  50.69 
 
 
334 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  46.71 
 
 
332 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  46.71 
 
 
352 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  48.34 
 
 
334 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  45.39 
 
 
332 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  43.12 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  42.31 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  42.04 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  41.5 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  41.67 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  39.74 
 
 
147 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  41.45 
 
 
161 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  43.67 
 
 
152 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  43.04 
 
 
152 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  39.35 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  43.54 
 
 
154 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  40.82 
 
 
155 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  41.4 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  41.29 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  45.27 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  41.29 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  43.95 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  46.1 
 
 
152 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  42.04 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  40 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  42.31 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  42.66 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  41.03 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  43.95 
 
 
157 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  41.4 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  39.61 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  37.82 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  38.61 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  38.46 
 
 
158 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  39.1 
 
 
151 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  43.26 
 
 
154 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  42.55 
 
 
163 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  37.18 
 
 
156 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  33.54 
 
 
152 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  38.96 
 
 
154 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  38.06 
 
 
153 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  37.66 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  41.78 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.836976 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  37.42 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  36.36 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  40.43 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  40.43 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  35.95 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  35.67 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  36.36 
 
 
153 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  37.06 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  35.03 
 
 
149 aa  90.9  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  37.86 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  35.67 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  31.01 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  32.47 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  37.69 
 
 
120 aa  87.8  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  37.91 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  34.19 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  31.17 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  32.68 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  34.75 
 
 
133 aa  84.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  33.55 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  35.26 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  30.52 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  30.52 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.92 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  34.23 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  26.75 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  27.33 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  27.33 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  37.18 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  27.33 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>