More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1312 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  346  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  74.34 
 
 
169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  66.67 
 
 
159 aa  204  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  68.97 
 
 
177 aa  201  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  63.29 
 
 
175 aa  201  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  65.36 
 
 
161 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  65.36 
 
 
161 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  65.36 
 
 
161 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  64.71 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  65.56 
 
 
164 aa  198  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  60.81 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  66.22 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  63.51 
 
 
165 aa  195  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  63.82 
 
 
185 aa  191  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  59.35 
 
 
175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  60.65 
 
 
160 aa  187  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  60.14 
 
 
176 aa  184  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  58.11 
 
 
166 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  59.72 
 
 
154 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  57.43 
 
 
150 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  56.76 
 
 
169 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  54.42 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  53.74 
 
 
150 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  54.73 
 
 
159 aa  167  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  53.06 
 
 
150 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  54.48 
 
 
150 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  52.38 
 
 
150 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  64.86 
 
 
161 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  52.9 
 
 
175 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  52.9 
 
 
175 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  52.9 
 
 
216 aa  157  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  51.35 
 
 
175 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  51.28 
 
 
175 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  51.28 
 
 
175 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  51.28 
 
 
175 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  51.75 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  51.03 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  51.05 
 
 
166 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  50.64 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  48.3 
 
 
153 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  48.3 
 
 
153 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  48.63 
 
 
169 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  48.03 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  49.68 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  48.98 
 
 
150 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  47.97 
 
 
174 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  43.62 
 
 
172 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  43.62 
 
 
172 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  48.25 
 
 
149 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  48.28 
 
 
150 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  48.28 
 
 
149 aa  144  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  46.62 
 
 
172 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  47.95 
 
 
184 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  47.26 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  44.51 
 
 
168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  45.21 
 
 
168 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  46.94 
 
 
163 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  47.55 
 
 
150 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  44.59 
 
 
150 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  48 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  46.26 
 
 
149 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  43.71 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  46.21 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  46.9 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  42.95 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  45.21 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  43.45 
 
 
199 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  43.84 
 
 
171 aa  121  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  43.79 
 
 
156 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  43.92 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  42.47 
 
 
169 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  42.57 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  42.47 
 
 
169 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  41.89 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  37.97 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  39.04 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  42.07 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  36.6 
 
 
161 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  40.65 
 
 
172 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 
348 aa  95.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  37.33 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  38.19 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  34.93 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  36.49 
 
 
160 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  32 
 
 
166 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  32.21 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  34.01 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  31.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  30.72 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  34.25 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>