148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3781 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  98.85 
 
 
348 aa  707    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  100 
 
 
348 aa  713    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  96.84 
 
 
348 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  87.07 
 
 
348 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  86.78 
 
 
347 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  85.63 
 
 
348 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  67.81 
 
 
353 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  62.46 
 
 
353 aa  441  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  62.46 
 
 
353 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  61.6 
 
 
349 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  61.71 
 
 
352 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  60.46 
 
 
359 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  62.86 
 
 
349 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  63.1 
 
 
343 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  61.6 
 
 
343 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  61.82 
 
 
343 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  61.82 
 
 
343 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  60 
 
 
344 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  59.09 
 
 
346 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  59.77 
 
 
343 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  49 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  48.43 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  31.87 
 
 
344 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  28.32 
 
 
332 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  32.46 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  27.84 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  34.34 
 
 
168 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  29.28 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  29.18 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
169 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  35.86 
 
 
168 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  38.26 
 
 
166 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  28.66 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  26.12 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  35.14 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  38.78 
 
 
164 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  37.82 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  29 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  32.64 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  32.64 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  34.25 
 
 
172 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
150 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  31.76 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  31.33 
 
 
166 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  31.54 
 
 
175 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  31.33 
 
 
166 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  29.37 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  30.46 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  30.41 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  31.47 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  30.14 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  33.11 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  32.65 
 
 
172 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  31.97 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  30.92 
 
 
164 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  29.45 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  30.13 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  30.13 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  30.13 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  29.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  29.45 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  33.1 
 
 
184 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1591  MaoC domain protein dehydratase  29 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  31.72 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  30.26 
 
 
164 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  28.78 
 
 
159 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  31.78 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  32.21 
 
 
160 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  28.38 
 
 
150 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  30.87 
 
 
185 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  31.03 
 
 
175 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  31.03 
 
 
175 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  31.03 
 
 
216 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  31.75 
 
 
169 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  30.61 
 
 
150 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  26.85 
 
 
174 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  31.71 
 
 
177 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  31.25 
 
 
175 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
150 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  31.25 
 
 
175 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  31.25 
 
 
175 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  32 
 
 
161 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  31.25 
 
 
175 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  31.69 
 
 
184 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  31.54 
 
 
162 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
166 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  31.51 
 
 
149 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  28.66 
 
 
171 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  27.4 
 
 
153 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  30.16 
 
 
167 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>