43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10218 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  69.5 
 
 
342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  71.43 
 
 
331 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  70.39 
 
 
328 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  71.43 
 
 
348 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  71.43 
 
 
331 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  62.8 
 
 
333 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  60.54 
 
 
332 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  55.65 
 
 
343 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  51 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  29 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  29 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  29 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  27.61 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  28.21 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  27.65 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  28.57 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  27.1 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  28.7 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  29.5 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  27.73 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  28.36 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  27.95 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  28.39 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  29.39 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  26.71 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  25.88 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  27.35 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  28.08 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  25.39 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  26.21 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  24.85 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  32.69 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  25 
 
 
166 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  25 
 
 
166 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  33.06 
 
 
176 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  28.18 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  30.08 
 
 
165 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  28.86 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1591  MaoC domain protein dehydratase  26.49 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  28.23 
 
 
160 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  26.67 
 
 
173 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>