108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1483 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 
143 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  35.82 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  35.29 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  35.82 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  41.67 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  34.68 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  35.96 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  36.43 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  35.29 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  34.45 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  30.88 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  30.88 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  34.19 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  30.88 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  32.23 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  34.88 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  35.66 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  37.17 
 
 
348 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  38.67 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  36.25 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  31.06 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  29.41 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  31.45 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  31.39 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  30.08 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  29.63 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  36.28 
 
 
348 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  36.28 
 
 
348 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  29.63 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  29.63 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.2 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  32.11 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  32.12 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 
335 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.67 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  28.95 
 
 
326 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  31.96 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  31.75 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  36.84 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 
142 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  29.48 
 
 
412 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.77 
 
 
337 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  33.33 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  31.39 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  24.03 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  29.05 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  30.77 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  36 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  31.39 
 
 
332 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  31.09 
 
 
332 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  24.8 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  25.99 
 
 
393 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  30.53 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  27.5 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  25.2 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2979  dehydratase  29.03 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  30.38 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  34.95 
 
 
144 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  30.37 
 
 
136 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  28.36 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  24 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  32.1 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  29.11 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  32.41 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  32.1 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  29.11 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.67 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  31.94 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  29.11 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  22.96 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  26.32 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  27.68 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  29.77 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34.67 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0851  hypothetical protein  26.17 
 
 
281 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.110102  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  26.47 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  24.8 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.63 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  26.92 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0908  dehydratase  24.44 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  34.33 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  26.45 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  27.69 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  25.2 
 
 
138 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>