297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3812 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  100 
 
 
156 aa  327  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2979  dehydratase  88.08 
 
 
170 aa  281  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  82.24 
 
 
154 aa  259  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  51.43 
 
 
184 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  31.94 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.12 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 
684 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  29.66 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.34 
 
 
464 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  29.61 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  31.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  28.47 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.58 
 
 
470 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.14 
 
 
472 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  26.9 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  31.94 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  28.28 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  29.45 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.94 
 
 
471 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  27.78 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  28.97 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.99 
 
 
679 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
684 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
684 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.55 
 
 
695 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  28.08 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
683 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  29.14 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  27.78 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  30.16 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  29.92 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2797  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.33 
 
 
469 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 
686 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  35.04 
 
 
686 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1929  MaoC family protein  30.16 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.988718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  27.81 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  27.81 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  30.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  27.81 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1965  maoC family protein  29.92 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000123748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  27.21 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  30.2 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  27.21 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
684 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  34.55 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  25.85 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  27.21 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  28.76 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
683 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.89 
 
 
472 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.97 
 
 
472 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  32.46 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
682 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.58 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  32.46 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  27.78 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  29.58 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  31.21 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.09 
 
 
690 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  29.86 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  32.79 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  33.33 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  26.53 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  26.76 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  33.33 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  33.33 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  26.85 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  26.53 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  30.14 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  39.36 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
681 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  29.93 
 
 
683 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  25.85 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
690 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.37 
 
 
681 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  29.91 
 
 
133 aa  54.3  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
681 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3103  MaoC domain protein dehydratase  29.22 
 
 
179 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
681 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  27.22 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  27.74 
 
 
134 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1955  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.57 
 
 
472 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435715  normal  0.221917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  26.53 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  30.5 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  33.03 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1468  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.43 
 
 
478 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  29.87 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  27.81 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  28.37 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  31.51 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>