More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1553 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  100 
 
 		 161 aa  340  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  90.06 
 
 		 161 aa  316  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  80.79 
 
 		 152 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  80.79 
 
 		 152 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  80.79 
 
 		 152 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  80.13 
 
 		 152 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  80.13 
 
 		 152 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  80.13 
 
 		 152 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  80.27 
 
 		 153 aa  258  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  79.59 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  79.59 
 
 		 151 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  79.47 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  46.26 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  41.38 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  37.93 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  31.29 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  31.37 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  36.24 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  30.52 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  34.21 
 
 		 686 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  33.57 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  30.87 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  29.25 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  32.26 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.29 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  32.67 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  32.17 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.41 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  35.1 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  31.29 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  32.87 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.41 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.25 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.69 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  28.97 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  30.14 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.25 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.24 
 
 		 679 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  34.23 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.26 
 
 		 500 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  30.82 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  33.09 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  28.99 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  29.17 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  29.25 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  31.03 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3102  MaoC domain protein dehydratase  27.94 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  29.17 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  32.52 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  30.41 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.26 
 
 		 480 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  28.19 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  26.57 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  28.67 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  27.78 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 685 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  26.97 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28.76 
 
 		 686 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  31.1 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  30.99 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  34.19 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  30.07 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.09 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  26.53 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  29.76 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  32.05 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  29.05 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  31.08 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  32.28 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  38.14 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.88 
 
 		 467 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  26.62 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  32.43 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  28.28 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  34.42 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  32.28 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  32.04 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.72 
 
 		 687 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  28.19 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  27.08 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  31.78 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  29.66 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  28.03 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 695 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  29.25 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  25.52 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>