33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2787 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  100 
 
 
126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  60.8 
 
 
133 aa  153  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  63.25 
 
 
143 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  62.3 
 
 
129 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  61.48 
 
 
133 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  59.84 
 
 
133 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  59.84 
 
 
133 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  59.66 
 
 
141 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  56.91 
 
 
138 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  57.72 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  57.6 
 
 
143 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  55.83 
 
 
129 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  57.5 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  58.82 
 
 
133 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  45.6 
 
 
148 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  50 
 
 
132 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  38.76 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  34.02 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.65 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.65 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.65 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  30.93 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  30.93 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  30.93 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.12 
 
 
337 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  29.59 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  31.4 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  28.24 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  31.25 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  30.48 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>