43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0886 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  70.31 
 
 		 133 aa  189  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  70.31 
 
 		 133 aa  189  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  71.65 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  69.6 
 
 		 133 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  67.97 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  72.27 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  64.23 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  59.66 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  57.36 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  53.38 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  56.56 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  57.38 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  56.1 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  46.4 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  43.2 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  40.95 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  36.56 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  32.23 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  32.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  32.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  32.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.73 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.73 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.73 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  30.49 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  33.65 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  30.28 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  27.87 
 
 		 335 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  31.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  23.89 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  30.89 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  33.02 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  28.92 
 
 		 326 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  29.85 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.63 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  23 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  32.32 
 
 		 149 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  27.48 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  23 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  27.88 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  28 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  28 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>