36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5452 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  97.7 
 
 
348 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  97.7 
 
 
348 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  98.56 
 
 
348 aa  708    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  97.7 
 
 
348 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  98.56 
 
 
348 aa  708    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  98.56 
 
 
348 aa  708    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  97.41 
 
 
348 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1482  hypothetical protein  31.11 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000942225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  36.28 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.38 
 
 
319 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  25.22 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  36.27 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1852  hypothetical protein  27.48 
 
 
178 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  31.3 
 
 
179 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  29.93 
 
 
175 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  29.93 
 
 
175 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  29.93 
 
 
175 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  27.37 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  30.71 
 
 
158 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  25.45 
 
 
158 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.52 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  26.47 
 
 
156 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  26.47 
 
 
156 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  26.47 
 
 
156 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  30.5 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  25.44 
 
 
337 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  29.14 
 
 
152 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  46.2  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  32.98 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  28.83 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  26.75 
 
 
145 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  30.16 
 
 
149 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  29.08 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  31.15 
 
 
147 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>