63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2585 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  88.93 
 
 		 280 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  76.62 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  76.62 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  76.9 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  75.91 
 
 		 286 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  59.15 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  58.42 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  60.35 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  60.57 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  60.67 
 
 		 285 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  62.02 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  61.05 
 
 		 301 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  61.05 
 
 		 301 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  59.65 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  58.57 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  61.42 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  57.14 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  59.03 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  56.6 
 
 		 278 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  54.58 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.72 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  51.82 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  53.62 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  51.97 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  51.75 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  50.19 
 
 		 282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  48.87 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  48.12 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  47.17 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  47.84 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  47.08 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  45.94 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  48 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  46.57 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  49.78 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.14 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.59 
 
 		 279 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  46.95 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.65 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  44.96 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  47.81 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  47.25 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.32 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  48.38 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  43.62 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  43.62 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  43.53 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.36 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  44.29 
 
 		 285 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  42.55 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.61 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.05 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 334 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  30.13 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 379 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.49 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.18 
 
 		 87 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 620 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  29.08 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  29.08 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>