59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5229 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  67.64 
 
 		 277 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  51.56 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  52.67 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  53.07 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  55 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  51.25 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  53.79 
 
 		 285 aa  262  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  48.91 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  46.35 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  46.35 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  49.28 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  43.1 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  45.64 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  44.25 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  47.78 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  47.45 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  46.91 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  46.27 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  47.58 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  42.86 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  45.36 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  44.48 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  44.71 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  44.71 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  45.85 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  44.06 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  48.41 
 
 		 275 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  48.61 
 
 		 275 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  44.64 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  43.55 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  45.9 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  46.27 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.74 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  47.15 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  44.72 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  43.62 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  44.95 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  44.95 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  46.57 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  43.86 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  49.65 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  44.68 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  43.75 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  46.47 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  44.27 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  42.09 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  44.66 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  45.24 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  42.13 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 376 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  33.05 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.42 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  30.92 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.06 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>