61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6271 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  97.15 
 
 		 281 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  59.01 
 
 		 280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  64.02 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  64.02 
 
 		 286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  60.67 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  63.64 
 
 		 286 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  63.64 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  63.64 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  59.93 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  56.36 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  59.57 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  59.57 
 
 		 301 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  55.67 
 
 		 300 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  56.46 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  58.91 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  58.97 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  55.64 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  53.33 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  56.93 
 
 		 302 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  51.22 
 
 		 349 aa  254  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  50.56 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  48.87 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  51.75 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  50.37 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  51.13 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  47.19 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  47.58 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  46.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  49.08 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.25 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.35 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  48.99 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.56 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  46.06 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.57 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  51.95 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  49.4 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  46.04 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.86 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  48.33 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.35 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  42.2 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  42.2 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  44.66 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  43.71 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  46.06 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.15 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  46.84 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  38.68 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  36.23 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  38.78 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  34.85 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.76 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  27.52 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>