59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6786 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  59.86 
 
 		 284 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  58.48 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  57.91 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  57.91 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  55.32 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.12 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  49.47 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  52.67 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  48.42 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  45.74 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  42.47 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  46.69 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  44.77 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  46.29 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  44.72 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  44.06 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  44.72 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  44.72 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  44.96 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  45.36 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.65 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  43.26 
 
 		 285 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  49.65 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  44.83 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  43.01 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  44.98 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  42.55 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  44.72 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  42.65 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  42.96 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  45.56 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  45.66 
 
 		 349 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  42.09 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  42.14 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  46.06 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  42.66 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  42.96 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  43.75 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  41.73 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  41.79 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  42.18 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  43.02 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  44.36 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.28 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  46.31 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  46.91 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  43.49 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  40.58 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  42.15 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  38.78 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  31.85 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 		 334 aa  85.5  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  29.54 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  35.84 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  24.49 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>