62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5975 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  97.15 
 
 		 285 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  61.62 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  61.42 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  64.39 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  64.77 
 
 		 286 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  64.77 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  64.77 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  64.77 
 
 		 286 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  56.36 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  59.55 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  56.83 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  59.21 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  59.21 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  55.32 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  58.91 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  58.97 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  54.07 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  56 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  56.57 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  49.62 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  50.87 
 
 		 349 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  51.34 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  51.94 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  47.94 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  51.5 
 
 		 280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  52.24 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  49.61 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  47.04 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  47.04 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.44 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  48.87 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  53.25 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  46.13 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.73 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  46.32 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.97 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.19 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  45.49 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  49.2 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.49 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  48.76 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  45.35 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  43.98 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  43.89 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  45.59 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  46.84 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  38.93 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  36.6 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  40.08 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  34.85 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 		 379 aa  85.9  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.23 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.62 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  29.33 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 620 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>