60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1345 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  64.16 
 
 
278 aa  357  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  64.16 
 
 
278 aa  357  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  62.59 
 
 
277 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  59.86 
 
 
283 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  52.04 
 
 
285 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  53.33 
 
 
285 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  52.11 
 
 
283 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  52.96 
 
 
291 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  54.39 
 
 
285 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  53.71 
 
 
283 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  48.76 
 
 
294 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  47.52 
 
 
300 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  48.2 
 
 
277 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  47.22 
 
 
287 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  44.48 
 
 
294 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  45.83 
 
 
300 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  47.54 
 
 
286 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  45.29 
 
 
280 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  46.83 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  45.42 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  43.21 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  45.32 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  42.86 
 
 
301 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  47.24 
 
 
285 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  48.55 
 
 
279 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  44.4 
 
 
281 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  45.16 
 
 
286 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  45.16 
 
 
286 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  43.82 
 
 
285 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  45.16 
 
 
286 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.72 
 
 
279 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  46.74 
 
 
349 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  45.62 
 
 
286 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.49 
 
 
281 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  48.76 
 
 
285 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  45.91 
 
 
285 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  49.4 
 
 
285 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  45.71 
 
 
280 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.66 
 
 
275 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  42.86 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.04 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  48.39 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  42.81 
 
 
285 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  45.56 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.1 
 
 
282 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  44.16 
 
 
282 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  42.65 
 
 
283 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  41.58 
 
 
284 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  40.94 
 
 
278 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  37.27 
 
 
286 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  42 
 
 
280 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  35.63 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  34.85 
 
 
292 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.77 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  24.88 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  37.1 
 
 
87 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>