60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3796 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  48.38 
 
 
280 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  47.5 
 
 
280 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  48.7 
 
 
282 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  49.46 
 
 
286 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  49.46 
 
 
286 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  49.64 
 
 
286 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  49.64 
 
 
286 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  50.53 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  43.4 
 
 
294 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  48.76 
 
 
284 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  45.76 
 
 
300 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  44.6 
 
 
281 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  48.03 
 
 
277 aa  208  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.21 
 
 
287 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  43.68 
 
 
300 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  44.44 
 
 
285 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.43 
 
 
278 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  44.2 
 
 
285 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  45.74 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  45.05 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  45.74 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  46.29 
 
 
301 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  46.29 
 
 
301 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  48.55 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  45.23 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.95 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  44.09 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  46.04 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  47.95 
 
 
278 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  46.24 
 
 
288 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  44.44 
 
 
285 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  42.6 
 
 
294 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  46.33 
 
 
302 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  46.15 
 
 
285 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  42.7 
 
 
283 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  45.38 
 
 
275 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  44.92 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.14 
 
 
275 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  43.73 
 
 
282 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  44.44 
 
 
283 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  43.37 
 
 
291 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  42.91 
 
 
281 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  46.02 
 
 
301 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  47.45 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  44.27 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  43.53 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  43.91 
 
 
281 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  46.43 
 
 
280 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  49.1 
 
 
279 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  39.42 
 
 
286 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  43.69 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  37.55 
 
 
292 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  35.98 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  35.98 
 
 
274 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 
334 aa  96.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 
376 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  23.05 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  44.33 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  39.71 
 
 
87 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>