59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0194 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  58.24 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  50.74 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  38.85 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  35.71 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  36.84 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  34.08 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  32.08 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  34.68 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  33.46 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  35.84 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  34.1 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  31.87 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  31.87 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  33.47 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  32.84 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  35.29 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  35.48 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  32.84 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  36.76 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  34.74 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  34.26 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  34.26 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  33.64 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  35.1 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  32.79 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  34.26 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  36.22 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  33.59 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  29.96 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  35.74 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  32.64 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  34.6 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  33.48 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  33.19 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  31.6 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  31.84 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  31.84 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  31.84 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  30.56 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  33.8 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  31.65 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  33.49 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  36.58 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  30.49 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  30.96 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  31.09 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  31.15 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  30.92 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25.11 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  32.22 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>