61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4177 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  88.3 
 
 		 284 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  79.29 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  51.09 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  47.54 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  51.64 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  51.27 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  51.27 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  48.93 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  48.58 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  51.43 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  49.44 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  48.57 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  50.36 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  47.7 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  47.54 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  46.39 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  46.74 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  46.95 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  46.57 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  46.62 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  44.9 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  48.34 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  48.89 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  44.29 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  45.09 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.93 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.93 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  46.95 
 
 		 349 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  46.94 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  43.8 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  47.17 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  44.36 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  47.31 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  42.55 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  42.55 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.09 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  42.27 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  45.49 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.49 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.32 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  42.24 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  43.33 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  40.07 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  41.83 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  44.09 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  42.13 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.42 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  41.44 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  44.44 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  43.09 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  43.95 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  34.65 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.64 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  32.37 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 376 aa  92  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.54 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  23.44 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  34.26 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>