59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4111 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  69.93 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  69.93 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  62.59 
 
 		 284 aa  343  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  58.48 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  54.45 
 
 		 285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  54.09 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  53.74 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  57.09 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  55.2 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  50.18 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  47.23 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  45.91 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  47.25 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  46.43 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  45.65 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  44.6 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  45.04 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  44.25 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  46.76 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  47.45 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  46.38 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  43.97 
 
 		 285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  45.02 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  44.94 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  45.16 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  45.1 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  45.42 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  47.69 
 
 		 302 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  43.21 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  44.77 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  45.04 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  43.57 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  43.35 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  42.76 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  43.07 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  43.59 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  42.96 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  48.03 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  43.77 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.25 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  48.31 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.77 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.01 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  43.73 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  45.06 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  39.78 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  43.13 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  35.37 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  29.71 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  34.68 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25.76 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>