60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3937 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  91.93 
 
 		 285 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  91.55 
 
 		 291 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  72.98 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  79.02 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  56.49 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  54.8 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  54.01 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  54.09 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  54.09 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  48.94 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  49.47 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  51.47 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  51.96 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  49.65 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  50.87 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  48.56 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  48.2 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  50.17 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  48.8 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  48.8 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  47.12 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  49.13 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  47.84 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  47.84 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  47.84 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  47.89 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.96 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  49.15 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  48.26 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  45.61 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  47.72 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  50.38 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  46.43 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  49.46 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  46.99 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  47.37 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.18 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  48.87 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  44.55 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  45.86 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  46.24 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.04 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  43.21 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  43.01 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  45.52 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  41.54 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  41.03 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  40.79 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  44.64 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  42.65 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.22 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.65 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  32.16 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.36 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  36.9 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>