60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1693 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  55.64 
 
 
282 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  50.9 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  51.09 
 
 
285 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  50.17 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  51.44 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  48.4 
 
 
294 aa  241  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  49.64 
 
 
286 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  50.71 
 
 
300 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  51.06 
 
 
285 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  50.18 
 
 
301 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  49.45 
 
 
280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  50.18 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  48 
 
 
280 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  46.59 
 
 
287 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  49.13 
 
 
285 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  49.08 
 
 
285 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  49.29 
 
 
302 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  48.55 
 
 
301 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  47.31 
 
 
281 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  46.18 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  49.66 
 
 
349 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  47.6 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  44.64 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  47.23 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  49.26 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  48 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  44.24 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  44.96 
 
 
285 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  48.34 
 
 
281 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  48.08 
 
 
285 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  47.04 
 
 
282 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  46.79 
 
 
283 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  42.59 
 
 
278 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  42.59 
 
 
278 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  44.6 
 
 
283 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  46.72 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  43.75 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  44.27 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  44.4 
 
 
283 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  43.53 
 
 
285 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  43.12 
 
 
275 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  41.91 
 
 
284 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  42.38 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  41.94 
 
 
277 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  41.54 
 
 
286 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  43.82 
 
 
279 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  39.75 
 
 
288 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  41.05 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  37.14 
 
 
292 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.55 
 
 
287 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  36 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.22 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
376 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.72 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  52.63 
 
 
87 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>