60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3045 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  70.41 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  69.66 
 
 		 275 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  64.94 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  46.35 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  47.45 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  47.15 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  47.15 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  47.15 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  46.13 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  46.82 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  45.83 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.4 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  45.59 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  46.64 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  45.76 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  45.76 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  44.37 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  47.04 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  45.49 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  44.19 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  45.72 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  44.07 
 
 		 300 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  45.86 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  45.9 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  52.43 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  44.24 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  46.27 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  43.7 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  48.26 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.72 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.62 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.3 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  45.86 
 
 		 291 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  44.53 
 
 		 284 aa  204  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  45.11 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  44 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  45.63 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  47.04 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  46.25 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  45.8 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.77 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  43.45 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  46.82 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  43.28 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  45.95 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  44.09 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  43.73 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  43.73 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  44.16 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  43.49 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  35.97 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  30.67 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 		 376 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  30.38 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25.12 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  36.49 
 
 		 87 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>