60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4807 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  70.16 
 
 
300 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  69.26 
 
 
294 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  67.54 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  66.34 
 
 
301 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  66.34 
 
 
301 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  61.51 
 
 
294 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  66.67 
 
 
302 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  57.62 
 
 
285 aa  348  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  58.69 
 
 
300 aa  338  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  57.72 
 
 
281 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  58.28 
 
 
285 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  57.24 
 
 
286 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  57.91 
 
 
286 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  57.58 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  57.58 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  54.24 
 
 
280 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  54.58 
 
 
280 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  52.48 
 
 
285 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  51.22 
 
 
285 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.17 
 
 
287 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  51.4 
 
 
278 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  52.72 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  49.83 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  50.87 
 
 
281 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  53.52 
 
 
282 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  54.4 
 
 
280 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  52.83 
 
 
285 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  43.2 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  50.81 
 
 
275 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  46.95 
 
 
282 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  49.32 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  49.8 
 
 
275 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  43.23 
 
 
285 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  44.74 
 
 
283 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  48.54 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.96 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.77 
 
 
277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.13 
 
 
284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  42.48 
 
 
285 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  46.07 
 
 
284 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  42.9 
 
 
291 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  47.55 
 
 
283 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  46.25 
 
 
279 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  48.41 
 
 
286 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  44.4 
 
 
280 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  45 
 
 
278 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  45 
 
 
278 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  46.3 
 
 
288 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  49.62 
 
 
285 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.76 
 
 
277 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  47.12 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
376 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  36.33 
 
 
287 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  34.32 
 
 
334 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.47 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  35.6 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
379 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  28.43 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  46.15 
 
 
87 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>