61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0908 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  88.3 
 
 		 282 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  76.33 
 
 		 283 aa  421  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  51.44 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  52.52 
 
 		 286 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  52.16 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  52.16 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  46.69 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  48.25 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  47.57 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  50.35 
 
 		 285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  48.57 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  47.18 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  45.32 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  49.06 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  47.18 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  46.83 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  49.82 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  46.07 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  47.67 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  45.67 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  45.39 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  45.8 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  44.37 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  48.15 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  44.6 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  46 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  47.17 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  44.53 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  47.43 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  42.71 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.8 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.03 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  41.16 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  44.49 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.1 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  43.12 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.63 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  45.99 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  42.5 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  40.62 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  38.7 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  41.85 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  40.79 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  42.23 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  42.81 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  40.46 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  41.16 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  39.86 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  42.81 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  43.78 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  35.04 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.35 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  33.06 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  39.74 
 
 		 87 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  34.23 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>