69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3808 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  88.77 
 
 
285 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  75.79 
 
 
281 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  69.07 
 
 
300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  67.48 
 
 
300 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  66.78 
 
 
294 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  66.44 
 
 
301 aa  363  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  67.13 
 
 
302 aa  361  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  66.1 
 
 
301 aa  361  9e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  61.59 
 
 
294 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  65.28 
 
 
301 aa  349  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  58.8 
 
 
280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  59.15 
 
 
280 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  58.1 
 
 
286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  58.1 
 
 
286 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  57.75 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  57.75 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  57.62 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  56.36 
 
 
285 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  56.36 
 
 
281 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  53.65 
 
 
278 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  53.5 
 
 
285 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  51.58 
 
 
287 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  54.29 
 
 
280 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.18 
 
 
286 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  52.48 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  50.37 
 
 
282 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  46.01 
 
 
281 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  46.56 
 
 
275 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.95 
 
 
275 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  49.12 
 
 
278 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  44.79 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  44.21 
 
 
285 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  44.91 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  44.91 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.97 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  44.33 
 
 
283 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.24 
 
 
284 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  43.7 
 
 
279 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  44.56 
 
 
284 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  46.69 
 
 
286 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  43.66 
 
 
278 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  43.66 
 
 
278 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  43.84 
 
 
282 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  43.26 
 
 
283 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  45.99 
 
 
285 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  45.26 
 
 
283 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  45.2 
 
 
288 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  44.2 
 
 
285 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  41.6 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  43.02 
 
 
277 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  42.61 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.93 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.88 
 
 
287 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  34.82 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 
376 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  33.19 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.89 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  43.59 
 
 
87 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  30 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  30 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  30 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  30 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  30 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  29.36 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>