69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1047 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  49.07 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  48.71 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  48 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  46.91 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  47.08 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  47.08 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  46.55 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  48.52 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  47.1 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  49.08 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  47.69 
 
 		 286 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  48.21 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  47.86 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  47.86 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  46.69 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  48.8 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  45.59 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  50.18 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  49.45 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  44.88 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  43.37 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  44.13 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  45.32 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.05 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  45.05 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  45.66 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  48.41 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  46.13 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  43.22 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  43.97 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  43.03 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  43.33 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  40.38 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.06 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  41.2 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  42.55 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  46.51 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  44.64 
 
 		 285 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.62 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  39.39 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  39.39 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  39.11 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  45.45 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  42.06 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  45.85 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  39.47 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  41.3 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  38.58 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  34.1 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.93 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.94 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  23.92 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.27 
 
 		 87 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>