62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1241 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  67.57 
 
 		 300 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  66.1 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  68.38 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  65.32 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  64.85 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  64.98 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  61.51 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  62.32 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  61.59 
 
 		 285 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  58.5 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  58.42 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  59.03 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  59.03 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  59.03 
 
 		 286 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  57.73 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  58.42 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  61.94 
 
 		 285 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  56.54 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  53.82 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  51.88 
 
 		 285 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  53.33 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  51.42 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  54.07 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  51.44 
 
 		 280 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  51.28 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  48.94 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  46.85 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  47.89 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.69 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  49.11 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.54 
 
 		 291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  45.45 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  44.6 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.91 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  47.15 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  49.07 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  47.15 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  46.45 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  43.82 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.19 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  48.03 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  44.48 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  42.47 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  44.37 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  44.37 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  43.4 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  41.9 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  43.72 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.03 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  42.56 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.92 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  32.08 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  35.22 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  24.46 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  48 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  34.94 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  32.95 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>