60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0197 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  80.98 
 
 		 301 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  80.66 
 
 		 301 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  71.29 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  73.29 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  69.74 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  64.85 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  67.21 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  65.28 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  66.21 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  62.72 
 
 		 280 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  63.03 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  61.84 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  64.93 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  62.02 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  61.89 
 
 		 286 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  61.89 
 
 		 286 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  60.62 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  58.97 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  56.99 
 
 		 278 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  58.97 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  57.65 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  52.45 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  52.96 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  52.28 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  53.17 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  51.09 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.13 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  48.8 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  48.8 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  48.4 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  47.59 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  48.23 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  45.74 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  50.17 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  49.26 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  49.63 
 
 		 275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  48.46 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.04 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  48.15 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.9 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.74 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.82 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  47.1 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.07 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  44.13 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  44.13 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.45 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.49 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.02 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  47.19 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  34.63 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  37.18 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.86 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31.37 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  34.39 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.76 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.95 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>