60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2026 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  76.21 
 
 		 294 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  71.52 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  68.38 
 
 		 294 aa  414  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  70.39 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  72.3 
 
 		 301 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  71.96 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  67.13 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  66.67 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  65.19 
 
 		 300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  68.86 
 
 		 285 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  65.26 
 
 		 281 aa  345  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  62.68 
 
 		 286 aa  332  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  62.68 
 
 		 286 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  62.68 
 
 		 286 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  59.72 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  62.68 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  59.72 
 
 		 280 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  56.84 
 
 		 285 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  56.93 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  57.19 
 
 		 285 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  54.26 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  54.21 
 
 		 278 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  56.57 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  52 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.54 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  49.45 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  50.18 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.13 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  46.45 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.96 
 
 		 285 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.55 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  49.3 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  47.93 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  46.1 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  47.58 
 
 		 279 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  45.8 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.74 
 
 		 284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  49.8 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  49.6 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  47.18 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  49.45 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.79 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  47.52 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  44.76 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  44.76 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  44.22 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  44.06 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  42.55 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  46.53 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.95 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.71 
 
 		 279 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.98 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  33.47 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  32.01 
 
 		 379 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.05 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.32 
 
 		 87 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>