60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0119 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  99.67 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  80.66 
 
 
301 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  73.67 
 
 
300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  72.11 
 
 
294 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  71.62 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  64.98 
 
 
294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  66.02 
 
 
349 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  66.1 
 
 
285 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  64.51 
 
 
300 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  66.44 
 
 
285 aa  358  8e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  63.19 
 
 
281 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  61.32 
 
 
286 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  62.11 
 
 
280 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  62.37 
 
 
286 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  60.69 
 
 
286 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  60.69 
 
 
286 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  61.05 
 
 
280 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  59.57 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  56.27 
 
 
278 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  58.12 
 
 
281 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  52.41 
 
 
285 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  53.77 
 
 
287 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  54.04 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.17 
 
 
286 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  51.64 
 
 
282 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  50.69 
 
 
280 aa  255  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  48.97 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.14 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  48.12 
 
 
291 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  49.28 
 
 
275 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  47.54 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  49.83 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  45.83 
 
 
283 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.04 
 
 
284 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  47.08 
 
 
285 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  48.55 
 
 
275 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  48.77 
 
 
278 aa  228  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.76 
 
 
279 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  44.6 
 
 
277 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  47.1 
 
 
283 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  47.25 
 
 
286 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  46.38 
 
 
281 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  43.55 
 
 
284 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.17 
 
 
283 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  43.01 
 
 
278 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  43.01 
 
 
278 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  46.27 
 
 
280 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.29 
 
 
285 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.9 
 
 
277 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  45.2 
 
 
288 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.22 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 
376 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.31 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31.89 
 
 
274 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  31.8 
 
 
292 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  33.47 
 
 
334 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
379 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25.45 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  48.05 
 
 
87 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>