45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1008 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  100 
 
 		 87 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  48.05 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  48.05 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  47.95 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  48 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  49.32 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  54.84 
 
 		 278 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  52.46 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  50.79 
 
 		 285 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  51.61 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  50.82 
 
 		 300 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  46.75 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  47.95 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  49.18 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  48.39 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  50.82 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  49.18 
 
 		 286 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  43.59 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  49.18 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  49.18 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  49.21 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  43.59 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  49.18 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  47.62 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  57.89 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  59.46 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  47.69 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  49.21 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  49.09 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  62.16 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  52.63 
 
 		 278 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  58.33 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  47.27 
 
 		 286 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  42.19 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  36.49 
 
 		 281 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  41.94 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  39.71 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  37.1 
 
 		 284 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  36.49 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  37.7 
 
 		 285 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  39.34 
 
 		 275 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  41.94 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>