60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3340 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  56.2 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  55.84 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  55.84 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  54.29 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  55.84 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  53.62 
 
 		 280 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  51.58 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  51.44 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  51.8 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  54.26 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  51.08 
 
 		 300 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  53.24 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  50.89 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  54.64 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  54.12 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  51.45 
 
 		 285 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.53 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.88 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  51.05 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  51.05 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  47.89 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  51.13 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  54.4 
 
 		 349 aa  244  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  51.56 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  51.5 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  47.46 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.52 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.62 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  47.6 
 
 		 282 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.86 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.81 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.63 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.21 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  43.32 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  43.32 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  46.35 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.71 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  43.62 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  44.44 
 
 		 285 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  44.77 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  43.43 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  42.5 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  41.84 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.75 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  45.66 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  40.71 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  41.22 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  41.44 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.43 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  43.42 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  31.3 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31.51 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  31.4 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  27.78 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.62 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>