60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2579 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  53.18 
 
 
285 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  55.63 
 
 
291 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  56.49 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  59.44 
 
 
283 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  57.75 
 
 
277 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  55.09 
 
 
284 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  57.69 
 
 
278 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  57.69 
 
 
278 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  55.83 
 
 
283 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  50.88 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  51.61 
 
 
277 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  52.56 
 
 
300 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  49.3 
 
 
294 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  50.34 
 
 
301 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  50.34 
 
 
301 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  54.15 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  53.79 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  49.15 
 
 
294 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  49.83 
 
 
301 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  50.53 
 
 
302 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  45.96 
 
 
285 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  52.08 
 
 
349 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  51.41 
 
 
286 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  45.77 
 
 
280 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  47.29 
 
 
286 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  45.07 
 
 
280 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  48.74 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  46.43 
 
 
281 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  46.44 
 
 
282 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  46.02 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  45.8 
 
 
300 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  45.07 
 
 
285 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  45.91 
 
 
288 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  43.59 
 
 
283 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  44.1 
 
 
285 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  45.16 
 
 
285 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  43.59 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  47.66 
 
 
275 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  44.44 
 
 
280 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  46.88 
 
 
275 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  45.72 
 
 
281 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  46.83 
 
 
285 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  45.27 
 
 
278 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  43.28 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.02 
 
 
281 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  42.75 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  43.53 
 
 
278 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  43.49 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.7 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  33.62 
 
 
287 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 
376 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  31.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  33.08 
 
 
274 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.94 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  28.22 
 
 
379 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  37.7 
 
 
87 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>