60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6893 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  56.54 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  56.89 
 
 		 300 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  57.24 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  56.69 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  55.36 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  53.29 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  53.29 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  54.64 
 
 		 286 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  55.96 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  54.29 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  54.29 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  53.82 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  53.68 
 
 		 285 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  52.48 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  52.16 
 
 		 280 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  53.15 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  50.72 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  52.14 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  54.74 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  49.29 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  52.53 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  51.75 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  48.56 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  48.53 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  50.36 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  50.75 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  46.79 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  48.76 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.4 
 
 		 281 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  48.41 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  46.83 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  46.32 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  45.26 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  44.7 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  44.7 
 
 		 275 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  44.68 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  45.09 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  43.97 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  44.6 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  43.42 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  45.32 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  42.81 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  42.81 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  43.06 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  44.66 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  45.63 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  40.14 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  44.92 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.13 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  31.7 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  33.75 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.78 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  47.95 
 
 		 87 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>