60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58974 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  100 
 
 
296 aa  616  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  27.49 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  28.3 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  24.46 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  28.3 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  26.29 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  26.89 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  27.49 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  26.14 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  24.88 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  28.9 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  24.66 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  26.76 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  25.23 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  26.79 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  26.79 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  25.23 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  25.23 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  26.07 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  26.9 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  26.05 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  27.23 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  25.76 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  25.96 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  25.12 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  23.92 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  26.24 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  26.75 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  25.37 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  25.53 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  28.43 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  22.85 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  27.1 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  26.42 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  26.76 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  25.4 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  27.19 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  27.06 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  26.37 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  25.87 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  24.88 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  23.93 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  23.56 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  23.05 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  21.79 
 
 
376 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  24.22 
 
 
274 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  24.81 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  23.92 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  24.49 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  23.94 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  25.82 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  23.44 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  29.35 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  24.69 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  28.44 
 
 
127 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>