60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3897 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  77.14 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  51.82 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  50.71 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  50.18 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  52.13 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  50.18 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  51.41 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  51.97 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  50.35 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  48.06 
 
 		 286 aa  254  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  51.2 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  50.17 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  50.17 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  52.28 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  48.03 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  48.03 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  48.39 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  52.54 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  48.56 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  49.83 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  50.88 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  49.64 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  49.64 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  48.26 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  50.18 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  48.99 
 
 		 282 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  47.19 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  48.94 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  47.77 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  47.94 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  47.69 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  47.76 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  46.43 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  47.86 
 
 		 283 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.54 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  46.99 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  51.61 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.86 
 
 		 281 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  45.86 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  44.96 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  42.8 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  44.72 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  42.91 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  43.88 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  46.43 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  47.83 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  44.27 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  44.62 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  48.55 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  40.38 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.96 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  32.54 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.24 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  33.65 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  30.42 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  24.66 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.21 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>