61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2143 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  88.58 
 
 		 294 aa  520  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  74 
 
 		 301 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  73.67 
 
 		 301 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  71.52 
 
 		 302 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  71.29 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  67.57 
 
 		 294 aa  414  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  70.16 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  67.48 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  65.86 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  66.78 
 
 		 285 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  63.12 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  64.06 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  61.33 
 
 		 286 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  60.7 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  63.03 
 
 		 286 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  63.03 
 
 		 286 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  60.57 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  59.93 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  56.69 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  56.78 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  59.55 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  57.3 
 
 		 285 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  51.23 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  50.53 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  50.35 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  51.71 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  48.98 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  48.4 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  47.39 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  49.48 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  49.83 
 
 		 291 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  47.31 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  50.35 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.52 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  48.75 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  48 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.79 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  45.1 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  45.9 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  46.69 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  44.07 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  45.52 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  45.16 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  45.71 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  45.71 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  42.51 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  40.86 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  45.64 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  34.98 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  32.45 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  33.94 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  32.66 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  28.3 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  52.46 
 
 		 87 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  35.29 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>