61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6175 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  98.95 
 
 
286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  94.06 
 
 
286 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  77.34 
 
 
280 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  76.62 
 
 
280 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  63.03 
 
 
300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  62.41 
 
 
301 aa  351  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  62.07 
 
 
301 aa  349  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  59.79 
 
 
294 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  61.62 
 
 
294 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  61.64 
 
 
301 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  57.75 
 
 
285 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  63.64 
 
 
285 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  62.68 
 
 
302 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  57.77 
 
 
300 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  57.86 
 
 
281 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  58.1 
 
 
285 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  64.77 
 
 
281 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  55.56 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  57.58 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  55.43 
 
 
280 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  54.09 
 
 
285 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  53.38 
 
 
282 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  55.52 
 
 
285 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  49.65 
 
 
287 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  52.11 
 
 
283 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  51.41 
 
 
284 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  48.03 
 
 
286 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  51.06 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  50.18 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  48.67 
 
 
279 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  47.84 
 
 
285 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  47.39 
 
 
275 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.76 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  47.01 
 
 
275 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  44.98 
 
 
281 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  48.73 
 
 
283 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.84 
 
 
291 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  48.74 
 
 
278 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  47.12 
 
 
283 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  49.46 
 
 
285 aa  221  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  50 
 
 
286 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.42 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.27 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.36 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  50.7 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  45.26 
 
 
278 aa  209  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  45.26 
 
 
278 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  40.89 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  43.17 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.68 
 
 
279 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.9 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  34.51 
 
 
292 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
334 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
376 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31.84 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
379 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  25.56 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.18 
 
 
87 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  39.13 
 
 
147 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>