61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6655 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  98.95 
 
 
286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  98.95 
 
 
286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  94.41 
 
 
286 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  77.62 
 
 
280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  76.9 
 
 
280 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  61.33 
 
 
300 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  63.07 
 
 
301 aa  354  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  62.72 
 
 
301 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  59.79 
 
 
294 aa  348  5e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  62.28 
 
 
294 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  58.1 
 
 
285 aa  345  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  61.3 
 
 
301 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  63.64 
 
 
285 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  62.68 
 
 
302 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  58.68 
 
 
300 aa  328  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  58.45 
 
 
285 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  57.86 
 
 
281 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  64.77 
 
 
281 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  57.91 
 
 
349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  55.56 
 
 
278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  54.45 
 
 
285 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  55.84 
 
 
280 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  54.84 
 
 
285 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  53.38 
 
 
282 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  50.54 
 
 
287 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  51.93 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  51.96 
 
 
284 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  48.39 
 
 
286 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  51.61 
 
 
282 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  50.18 
 
 
277 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  48.31 
 
 
279 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  47.58 
 
 
275 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  47.84 
 
 
285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  46.76 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  46.84 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  45.49 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  49.09 
 
 
283 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  47.84 
 
 
291 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  48.74 
 
 
278 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  47.12 
 
 
283 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  45.42 
 
 
283 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  48.2 
 
 
286 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  49.46 
 
 
285 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  47.27 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  50.53 
 
 
285 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.52 
 
 
280 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  45.26 
 
 
278 aa  209  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  45.26 
 
 
278 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  41.58 
 
 
288 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  43.17 
 
 
277 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  44.4 
 
 
279 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  34.9 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  34.07 
 
 
292 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 
334 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 
376 aa  96.3  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  31.84 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  26.74 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  49.18 
 
 
87 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  39.13 
 
 
147 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>