61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2172 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52910  hypothetical protein  69.2 
 
 		 275 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4636  hypothetical protein  68.84 
 
 		 275 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3045  hypothetical protein  64.94 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2415  hypothetical protein  48.4 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2585  hypothetical protein  47.17 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404752  normal  0.257167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6604  hypothetical protein  45.62 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.316689  normal  0.0307895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7720  hypothetical protein  46.24 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6271  hypothetical protein  47.58 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  46.67 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3808  hypothetical protein  46.01 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6655  hypothetical protein  44.74 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  44.19 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4554  hypothetical protein  46.89 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6175  hypothetical protein  44.24 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5811  hypothetical protein  44.24 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3484  hypothetical protein  45.72 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  46.88 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6893  hypothetical protein  42.91 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  45.79 
 
 		 300 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5975  hypothetical protein  45.93 
 
 		 281 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0119  hypothetical protein  46.38 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0137  hypothetical protein  46.72 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3897  hypothetical protein  45.86 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.882849  normal  0.233489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  44.69 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0197  hypothetical protein  45.82 
 
 		 301 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  43.64 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2026  hypothetical protein  45.79 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4807  hypothetical protein  45.22 
 
 		 349 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132586  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1345  hypothetical protein  45.49 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3340  hypothetical protein  44.81 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.018033  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4111  hypothetical protein  42.96 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  43.4 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  43.17 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0656  hypothetical protein  41.04 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2851  hypothetical protein  45.91 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901774  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  42.45 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0148  hypothetical protein  42.54 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0167  hypothetical protein  42.54 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0310033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2493  hypothetical protein  46.75 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4636  hypothetical protein  45.31 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1332  hypothetical protein  43.96 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1047  hypothetical protein  42.49 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0113601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  41.52 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2579  hypothetical protein  44.02 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1693  hypothetical protein  43.38 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4267  hypothetical protein  41.24 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6665  hypothetical protein  43.13 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  40.62 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6786  hypothetical protein  41.79 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3796  hypothetical protein  42.91 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0990795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5229  hypothetical protein  43.66 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422973  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0221  hypothetical protein  31.11 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05191  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 376 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0819  hypothetical protein  28.86 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00410  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0194  hypothetical protein  30.69 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.59049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58974  predicted protein  23.92 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722044  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11129  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1008  MaoC like domain protein  36.49 
 
 		 87 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0456076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>