224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3482 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
319 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  44.01 
 
 
315 aa  245  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  43.31 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  44.69 
 
 
319 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  38.34 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  42.43 
 
 
317 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  39.94 
 
 
318 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  39.94 
 
 
318 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  43.81 
 
 
305 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  40.79 
 
 
317 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  40.46 
 
 
324 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  43.41 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  39.73 
 
 
311 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  41.48 
 
 
333 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  49.68 
 
 
173 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  49.21 
 
 
132 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  41.74 
 
 
136 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  39.23 
 
 
137 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  43.1 
 
 
136 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.69 
 
 
137 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  37.59 
 
 
137 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  39.84 
 
 
133 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  38.17 
 
 
137 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  40.15 
 
 
130 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  36.92 
 
 
146 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  39.23 
 
 
141 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.03 
 
 
140 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  39.53 
 
 
143 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  89.7  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  36.59 
 
 
177 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  37.32 
 
 
155 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  37.04 
 
 
548 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.56 
 
 
548 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  37.98 
 
 
550 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  37.98 
 
 
550 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.92 
 
 
136 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  34.11 
 
 
152 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  34.11 
 
 
152 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  37.1 
 
 
120 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  37.21 
 
 
550 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  35.48 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.01 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.56 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  36.49 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  38.71 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.35 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  41.88 
 
 
120 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  38.93 
 
 
135 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  36.97 
 
 
143 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.76 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  40.16 
 
 
144 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.08 
 
 
541 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  36.27 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.09 
 
 
132 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  38.28 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  35.81 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  42.7 
 
 
136 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  35.42 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  32.5 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  34.4 
 
 
128 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.04 
 
 
140 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.28 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  36.13 
 
 
140 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  39.02 
 
 
131 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.36 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.95 
 
 
132 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.82 
 
 
176 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.95 
 
 
129 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>