154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3995 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  75 
 
 		 167 aa  249  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.17 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  25.52 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.8 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3701  hypothetical protein  35.09 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  26.21 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  23.78 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  27.27 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  24.83 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  24.83 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  26.21 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  30.47 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  31.06 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  30.47 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.16 
 
 		 480 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  24.83 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.69 
 
 		 476 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  28.81 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  24.83 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.33 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  23.45 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  29.17 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  29.17 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  27.97 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  28.43 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  29.17 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  23.45 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  30.22 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  26.96 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  28.46 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  29.17 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4238  dehydratase  31.07 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  31.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  29.17 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  27.97 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.12 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  29.82 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  34.18 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  27.27 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  26.96 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  26.61 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  28.16 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  24.17 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  22.92 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  30.25 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  22.22 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  27.12 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  28.67 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.67 
 
 		 472 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  28.47 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  28.93 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  28.06 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  27.91 
 
 		 393 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  30 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.67 
 
 		 472 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 482 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  26.28 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 472 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  25.83 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 		 468 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 		 468 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  21.74 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  24.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.97 
 
 		 467 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  24.79 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  24.79 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  26.5 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  26.5 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  33.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  28.95 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  21.43 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  28.48 
 
 		 412 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  27.01 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  21.74 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  32.43 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  25.85 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2098  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.08 
 
 		 493 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>