84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5026 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  87.67 
 
 		 146 aa  271  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  76.03 
 
 		 146 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  59.59 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  57.72 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  56.85 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  56 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  48.63 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  48.41 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  48.41 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  47.62 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  28.95 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  34.53 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  34.85 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  36 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  34.4 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.03 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.37 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  32.19 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  35.38 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  34.65 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  31.51 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  36.15 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  31.09 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  39.6 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  34.65 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  34.15 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  32.26 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  32.28 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  29.7 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  34.39 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  34.39 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  34.39 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  33.11 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  33.08 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  34.35 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  33.86 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  33.63 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  33.33 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  31.17 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  31.78 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  32.8 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.16 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  36.47 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  36.47 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  27.91 
 
 		 158 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  31.37 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.16 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  30.23 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  27.89 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  31.25 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  31.25 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  32.14 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.16 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  26.5 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  32.26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  27.05 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  29.73 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  26.77 
 
 		 333 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  30.28 
 
 		 312 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  26.61 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  26.56 
 
 		 317 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  25.78 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  24 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  24 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>