50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4069 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  64.81 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.88 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  35.88 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  29.23 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  30.43 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  32.84 
 
 		 322 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  28.78 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  28.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  28.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  30.3 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  30.3 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  28.46 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  37.38 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  27.56 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  34.4 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  33.96 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  27.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  26.92 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  27.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  27.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  28.29 
 
 		 317 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  32.68 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  29.31 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  25.95 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  30.41 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  32.48 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  27.81 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  27.7 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  32.37 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  27.22 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  29.25 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  29.05 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  25.74 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.34 
 
 		 319 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  33.61 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  30.88 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  30.94 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  40.38 
 
 		 311 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>