80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0059 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  357  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  51.32 
 
 		 317 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  51.32 
 
 		 317 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  49.68 
 
 		 318 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  49.68 
 
 		 318 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  49.68 
 
 		 319 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  48.73 
 
 		 333 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  49.41 
 
 		 319 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  49.7 
 
 		 311 aa  141  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  46.99 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  47.02 
 
 		 322 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  45.78 
 
 		 315 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 321 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  47.62 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  43.54 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  34.85 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  36.79 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3221  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3272  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.82 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3210  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.342499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  29.73 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.34 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  32.12 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  29.71 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.03 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  32.12 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  30.97 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5358  hypothetical protein  31.11 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  32.12 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  30.41 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  34.44 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1482  hypothetical protein  28.02 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000942225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  30.67 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  33.81 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  35.85 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  27.07 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  26.62 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  29.08 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.23 
 
 		 335 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  57.89 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  26.52 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  27.91 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  31.78 
 
 		 343 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  31.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  28.45 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  28.45 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  28.45 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  33.07 
 
 		 153 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  32.59 
 
 		 145 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  30.89 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  28.35 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  31.06 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  31.06 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  31.06 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  24.82 
 
 		 393 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>