151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3318 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  43.31 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  46.58 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  45.96 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  40.73 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  43.14 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  41.41 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  41.41 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  42.09 
 
 		 317 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  43 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  43.79 
 
 		 322 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  45.89 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  44.55 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  45 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  46.99 
 
 		 173 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.13 
 
 		 137 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.15 
 
 		 138 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  39.55 
 
 		 136 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.13 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  43.53 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.59 
 
 		 146 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  29.55 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  34.11 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  34.19 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  36.22 
 
 		 548 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.43 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  34.85 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.87 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.05 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.79 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  36.13 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.17 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  40.17 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  35.2 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  34.11 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  33.07 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.84 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  36.22 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.71 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.9 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  32.65 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  27.03 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.16 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.51 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.56 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.03 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  33.55 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  27.42 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  27.42 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  27.42 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  27.42 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.05 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.23 
 
 		 135 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  37.4 
 
 		 136 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  30.7 
 
 		 120 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  32.28 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  26.88 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.97 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  26.88 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  26.88 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.05 
 
 		 148 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  31.45 
 
 		 153 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  31.71 
 
 		 140 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28 
 
 		 130 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  35.78 
 
 		 121 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  38.95 
 
 		 123 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>