161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0892 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  296  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  49.24 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  38.52 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  37.7 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  39.64 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  40.83 
 
 
139 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.48 
 
 
319 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  34.31 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.96 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.13 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.8 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  38.33 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.57 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  36.43 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.13 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  27.78 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  26.72 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.5 
 
 
321 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  32.86 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.45 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  30.65 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.07 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.05 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.48 
 
 
541 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  31.03 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  32.54 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  32.14 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  36.19 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.15 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  31.67 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.88 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  30.4 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  30.83 
 
 
548 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  27.48 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30 
 
 
548 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  28.79 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.12 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  31.45 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.12 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.96 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.06 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.68 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  34.23 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30.33 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  28.44 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.65 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  36.27 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  30.65 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.17 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.86 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.75 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.59 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  31.37 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  34.95 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.51 
 
 
312 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  30.43 
 
 
550 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.43 
 
 
550 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  34.82 
 
 
320 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  30.43 
 
 
550 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  28.8 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.26 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  32.2 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  32.61 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.23 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30.48 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  27.42 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  31.09 
 
 
318 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  30.51 
 
 
319 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  31.09 
 
 
318 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  32.54 
 
 
338 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  31.09 
 
 
317 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  32.54 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  30.95 
 
 
333 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  26.73 
 
 
311 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  32.54 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.32 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  29.82 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  27.07 
 
 
324 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  26.89 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  30.43 
 
 
334 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.38 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  31.48 
 
 
335 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>